El método numérico llamado método de la trisección no existe, sin embargo, resulta en un práctica interesante de programación.

La única diferencia entre el método de la bisección y el de la trisección es que, en este último, el intervalo de búsqueda de la raíz se divide en tres parte iguales.

La definición completa del examen se encuentra en https://www.scribd.com/doc/306301095/Ejercicios-Basicos-de-Programacion

Una posible solución

#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Thu May 20 19:36:44 2021
Me tomó 27 minutos resolver
27*3 + 15 min. para leer el texto = 96 min.
96 min. + 5 min. para subir a evirtual = 101 min.
@author: Angel Vázquez-Patiño
"""
from math import factorial

def seno(x):
    suma = 0
    for i in range(50):
        numerador = ((-1)**i)*(x**(2*i+1))
        denominador = factorial(2*i+1)
        suma += numerador/denominador
    return suma

def f(x):
    return seno(2*x+1)-(3/5)*x+1

def triseccion(f, a, b):
    aproximaciones = [(a+b)/2]
    e_a = 1 # para que entre al menos una vez al while
    while e_a > 0.000001:
        mi = a + (b-a)/3
        md = (mi + b)/2
        
        if f(a)*f(mi) < 0:
            aproximaciones.append((a+mi)/2)
            b = mi
        elif f(mi)*f(md) < 0:
            aproximaciones.append((mi+md)/2)
            a, b = mi, md
        elif f(md)*f(b) < 0:
            aproximaciones.append((md+b)/2)
            a = md
        elif f(mi) == 0:
            aproximaciones.append(mi)
            return aproximaciones
        elif f(md) == 0:
            aproximaciones.append(md)
            return aproximaciones
        
        e_a = abs((aproximaciones[-1]-aproximaciones[-2])/aproximaciones[-1])
    return aproximaciones

def grabar(lista, path):
    with open(path, 'w') as f:
        f.write('Aproximación, Valor\n')
        for i in range(len(lista)):
            f.write(str(i)+','+str(lista[i])+'\n')
a, b = -19, 3.5          
aproxs = triseccion(f, -19, 3.5)
grabar(aproxs, 'interciclo_resultados.csv')
# FIN de esta posible solución del examen (hay muchas otras formas de resolverlo)

# De aquí en adelante no es parte del examen
import numpy as np # Esto no he utilizado en la solución en sí del examen
from matplotlib import pyplot as plt # Esto no he utilizado en la solución en sí del examen
xs = np.linspace(a, b, 100)
ys = [seno(2*i+1)-3*i/5+1 for i in xs]
ys = np.array(ys)

plt.figure(figsize=(4,3))
plt.plot(xs, ys, label='$f(x)$', lw=2)
plt.scatter([1.21], [0], label='raíz', color='k')
plt.axhline(0, color='gray')
plt.axvline(0, color='gray')
plt.xlabel('x')
plt.ylabel('y')
plt.legend()
plt.show()

Prueba dos de la materia de Programación Orientada al Cálculo Científico del semestre marzo - agosto 2021. Tomado el día jueves 20 de mayo de 2021.

Planteamiento

El juego comienza generando una letra del alfabeto (incluyendo la letra ñ) de manera aleatoria (0.5 puntos). Con esa primera letra, el jugador 1 debe escribir una palabra. El jugador 2 debe escribir una siguiente palabra que comience con la letra con la que termina la palabra del jugador 1. Esa palabra debe ser una que no haya sido escrita antes por ningún jugador. De la misma manera, el jugador 1 debe escribir una nueva palabra que comience con la última letra de la última palabra escrita por el jugador 2. Esa palabra debe ser una que no haya sido escrita antes por ningún jugador. Se repite estos pasos hasta que termine el juego (1 punto). El juego termina cuando los dos jugadores, de manera sucesiva, no son capaces de escribir palabras diferentes (i.e., que no hayan sido ingresadas antes por cualquiera de los dos jugadores) o siguiendo la regla del juego (e.g., cuando el jugador escribe una palabra que no comienza con la última letra de la última palabra escrita) (1.5 puntos). Un jugador tiene la posibilidad de indicar que no puede escribir una palabra válida presionando la tecla Enter sin antes escribir ningún carácter; cuando en dos jugadas sucesivas se presiona Enter, se termina el juego (0.5 puntos). Gana el juego la persona que haya escrito el mayor número de caracteres (se suma la cantidad de caracteres de todas las palabras ingresadas por cada jugador); se lo debe indicar cuando termina el juego (0.5 puntos). Al finalizar el juego, todas las palabras (una palabra es una cadena de al menos un carácter) diferentes ingresadas por los jugadores deben ser escritas en un archivo junto con el puntaje de cada jugador (1 punto).

Si usa Python, la siguiente línea de código le ayuda a generar las letras del abecedario: import string; print(string.ascii_lowercase).

Ejemplos de la ejecución del juego se muestran en el documento Ejercicios Básicos de Programación.

Una posible solución

import string
from random import choice

def letra():
    letras = list(string.ascii_lowercase)
    letras.append('ñ')
    return choice(letras)

palabras1 = [] # palabras del jugador 1
palabras2 = [] # palabras del jugador 2

ultima_letra = letra()
palabras_repetidas = 0 # permite terminar el juego
palabras_que_comienzan_mal = 0 # permite terminar el juego
enters = 0 # permite terminar el juego
jugador = 1 # la uso como bandera
print(ultima_letra)
while palabras_repetidas < 2 and palabras_que_comienzan_mal < 2 and enters < 2:
    palabra = input('Jugador '+str(jugador)+': ')
    if palabra in palabras1 or palabra in palabras2:
        palabras_repetidas += 1
    else:
        palabras_repetidas = 0
    if palabra != '':
        if palabra[0] != ultima_letra:
            palabras_que_comienzan_mal += 1
        else:
            palabras_que_comienzan_mal = 0
    
    if palabra == '':
        enters += 1
    else:
        enters = 0
    if (not palabra in palabras1) and palabra != '' and palabra[0] == ultima_letra:
        if jugador == 1:
            palabras1.append(palabra)
        else: # cuando jugador es igual a 2
            palabras2.append(palabra)
            
    if palabra != '':
        ultima_letra = palabra[-1]
    
    if jugador == 1: # uso de la estrategia de bandera
        jugador = 2  # para cambiar de jugador en cada iteración
    else:
        jugador = 1

print('\nPalabras repetidas sucesivas:', palabras_repetidas)
print('Palabras sucesivas con primera letra incorrecta:', palabras_que_comienzan_mal)
print('\"Enters\" sucesivos:', enters, end='\n\n')

puntaje1, puntaje2 = 0, 0 # puntajes para los jugadores

for elemento in palabras1:
    puntaje1 += len(elemento)
for elemento in palabras2:
    puntaje2 += len(elemento)

if puntaje1 > puntaje2:
    print('¡Ganó jugador 1!')
elif puntaje2 > puntaje1:
    print('¡Ganó jugador 2!')
else:
    print('¡Hubo empate!')

print('\tJugador 1:', puntaje1, 'puntos.')
print('\tJugador 2:', puntaje2, 'puntos.')

with open('prueba2.csv', 'w') as f:
    f.write('Jugador 1, Jugador 2\n')
    longitud = max(len(palabras1), len(palabras2))
    for i in range(longitud):
        
        if not(i >= len(palabras1)):
            f.write(palabras1[i]+',')
        else:
            f.write(',')
        if not(i >= len(palabras2)):
            f.write(palabras2[i]+'\n')
        else:
            f.write(',\n')

Planteamiento

1. Lea CON PANDAS el archivo predictores_estacionarios_luego_de_mutual_info_regression.csv (3 puntos). La primera columna en el archivo es el índice (que es una fecha) que debe usar para el DataFrame 1 de pandas (4 puntos).
2. Para cada columna del DataFrame 1 de Pandas que contenga la información del archivo (no el índice del DataFrame), ajuste una recta. De cada recta ajustada a los datos, de cada columna del DataFrame 1, tome el valor de la pendiente. (8 puntos)
3. Genere un nuevo DataFrame 2 de Pandas que contenga las mismas columnas que el DataFrame 1 referido en el punto 1 y 2 (4 puntos). En la única fila que va a tener este nuevo DataFrame 2, debe poner las pendientes que calculó en el punto 2. Es decir, en cada columna debe estar la pendiente correspondiente a la recta ajustada a los datos de las columnas correspondientes del DataFrame 1 (4 puntos).
4. Guarde el nuevo DataFrame 2 de Pandas referido en el punto 3 como archivo csv (ponga el nombre que quiera al archivo) (3 puntos). El archivo csv no debe ser guardado con el índice que tiene el DataFrame (4 puntos).
5. Suba a EVIRTUAL solamente el archivo .py de su script. Debe subir un (1) script. Puede subir hasta las 09h00. Solamente calificaré lo que suba a EVIRTUAL.
   

Nota: La información del DataFrame 2 debe ser guardado utilizando Pandas.

Solución

import pandas as pd
from scipy.optimize import curve_fit

def f(x, m, a):
    ''' Función que evalua una función que es un polinomio de primer grado.
    x: valor de la abscisa
    m: valor de la pendiente
    a: valor del intercepto
    '''
    return m*x + a

# index_col = 0 indica que la primera columna del archivo se usará como índice
df1 = pd.read_csv('predictores_estacionarios_luego_de_mutual_info_regression.csv',
                  index_col=0)

df2 = pd.DataFrame(columns=df1.columns, index=['Pendiente'])

for columna in df1.columns:
    # línea que permite verificar resultados
    print('Columna', columna)
    parametros, _ = curve_fit(f, range(len(df1[columna])), df1[columna])
    # línea que permite verificar resultados
    print('\tPendiente: {0}\n\tIntercepto: {1}'.format(parametros[0], parametros[1]))
    df2[columna] = parametros[0]
    
# index=False indica que no se guardará el índice en el archivo csv
df2.to_csv('pendientes.csv', index=False)

clear all;
clc;

% Ejemplo que indica cómo graficar un conjunto de puntos en 3D. Estos
% puntos pueden ser datos producto de un experimento de dos variables
% independientes (x, y en este ejemplo) y una variable dependiente (z en
% este ejemplo).
%
% En este caso vamos a utilizar una función z = x^2 + y^2 para generar los
% datos de prueba de la variable dependiente (z). Como se dijo anteriormente,
% estos datos no necesariamente deben venir de una función definida, sino
% que pueden ser datos de algún experimento. Por lo tanto, dichos datos
% podrían no estar linealmente espaciados (en el ejemplo, gracias a la
% generación de datos aleatorios con rand, los datos de las variables
% independientes no son linealmente espaciados).

% Generación de 150 datos aleatorios que constituyen los valores de las
% variables independientes. Estos puntos (x,y) son los que serán evaluados
% con la función de un paraboloide.
x=rand(150,1)*20-10;
y=rand(150,1)*20-10;

% Generamos los datos de la variable dependiente evaluando la función en
% los puntos datos por las variables x, y.
z=x.^2+y.^2;

% Graficación de los puntos (gráfica de dispersión) en 3D.
subplot(2,2,1); scatter3(x,y,z); title('Scatter 3D')

% Dado que los puntos generados no son linealmente espaciados. Encontramos
% una función de interpolación que pase por cada uno de los datos datos.
F=TriScatteredInterp(x,y,z);

% Generamos datos linealmente espaciados desde el límite inferior de los
% datos de x (min(x)) hasta el límite superior de y (max(x)).
xlin=linspace(min(x),max(x));
% Generamos datos linealmente espaciados desde el límite inferior de los
% datos de x (min(y)) hasta el límite superior de y (max(y)).
ylin=linspace(min(y),max(y));

% Generamos una rejilla de malla (matriz) de datos linealmente espaciados
% que serán utilizados para la evaluación de la función interpolada (F)
[X,Y]=meshgrid(xlin,ylin);

% Evaluación de los puntos de la malla con la función (F) producto de la
% interpolación.
Z=F(X,Y);

subplot(2,2,2); surf(X,Y,Z); title('Superficie: z = x^2 + y^2')
subplot(2,2,3); mesh(X,Y,Z); title('Malla: z = x^2 + y^2')
subplot(2,2,4); contour(X,Y,Z);

Figura 1: resultado final del programa.

op1 if condition else op2

Example

userGender = '0' if userFields[1] == 'M' else '1'
userAge = '0' if userFields[2] == '18-24' else \
    '1' if userFields[2] == '25-34' else \
    '2' if userFields[2] == '35-49' else '3'

Another interesting way here.

Primer logo de la Agrupación pro Software Libre de la Universidad de Cuenca (por +Daniel Campoverde).

VIDEO QUE DA CÓMO COMPILAR  ARWPost http://youtu.be/zXvfQ4i0IJE

ARWpost:
ARWpost, is a Fortran program that reads WRF ARW input and output file and generate GrADS output files.

Once the output files have been generated, GrADS can be used to producing horizontal or vertical cross section plots of scalar fields (contours) or vector fields (barbs or arrows), vertical profiles and soundings.

$ tar -xvzf ARWpost_V3.tar.gz
$ cd ARWpost
$ ./configure

** WARNING: No path to NETCDF and environment variable NETCDF not set.
** would you like me to try to fix? [y]
y
Enter full path to NetCDF include directory on your system
/usr/local/include
Enter full path to NetCDF library directory on your system
/usr/local/lib
created new ./netcdf_links directory
total 0
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 18 abr 18 15:41 include -> /usr/local/include/
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 14 abr 18 15:41 lib -> /usr/local/lib/
Will use NETCDF in dir: /home/angelv/ARWpost/netcdf_links
------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.

   1.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, PGI compiler   
   2.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, Intel compiler   
   3.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, gfortran compiler

Enter selection [1-3] : 2  
------------------------------------------------------------------------
Configuration successful. To build the ARWpost, type: compile
------------------------------------------------------------------------

$ ./compile

Se dió el siguiente error:

    module_interp.f:(.text+0x6ece): undefined reference to `ncvgt_'
    collect2: ld devolvió el estado de salida 1
    make: [ARWpost.exe] Error 1 (no tiene efecto)

Instalación de Vis5D

Descargar desde la página web oficial: http://www.ssec.wisc.edu/~billh/vis5d.html

$ tar -xvzf vis5d+-1.3.0-beta.tar.gz
$ cd vis5d+-1.3.0-beta
$ ./configure --with-mixkit=/usr/lib64/

****************************************************
You need to install a 3D graphics library, preferably
the free OpenGL replacement, Mesa.  You can download
Mesa from the Mesa home page:
          http://www.mesa3d.org/
and install it by running:
       ./configure && make && su -c 'make install'
in the Mesa directory.
You may also need to run /sbin/ldconfig as root
to update the system after installing Mesa.
(First, add '/usr/local/lib' to /etc/ld.so.conf if
you installed Mesa under /usr/local, the default.)
****************************************************

Nota: Para borrar un repositorio en GNU/Linux fedora http://www.ibm.com/developerworks/ssa/linux/library/l-lpic1-v3-102-5/index.html

Hay que instalar Mesa

# yum install mesa-libGLU-devel

Luego de eso de nuevo (para instalar vis5d)

$ ./configure

.
.
.
checking for fcntl.h... yes
configure: creating ./config.status
config.status: creating vis5d+.pc
config.status: creating gtk/vis5dgtk.pc
config.status: creating gtk/gradients/Makefile
config.status: creating gtk/Makefile
config.status: creating po/Makefile.in
config.status: creating Makefile
config.status: creating src/Makefile
config.status: creating doc/Makefile
config.status: creating lui5/Makefile
config.status: creating util/Makefile
config.status: creating m4/Makefile
config.status: creating po/Makefile.in
config.status: creating config.h
config.status: creating src/api-config.h
config.status: src/api-config.h is unchanged
config.status: creating po/POTFILES
config.status: creating po/Makefile
config.status: creating po/POTFILES
config.status: creating po/Makefile

$ make
$ make check
# make install

Para instalar MixLib http://pkgs.org/centos-6-rhel-6/puias-computational-x86_64/MixKit-2.1-3.puias6.x86_64.rpm.html

1. Instalar puias release http://mirror.yandex.ru/fedora/russianfedora/russianfedora/free/el/releases/6/Everything/i386/os/
2. Instalar puias core http://puias.math.ias.edu/wiki/YumRepositories6
3. Instalar puias addon http://pkgs.org/centos-6-rhel-6/puias-i386/puias-addons-6-1.puias6.6.noarch.rpm.html
4. Instalar puias en sí como root rpm -Uvh puias-computational*rpm

# rpm -Uvh puias-computational*rpm
advertencia:puias-computational-6-1.puias6.5.noarch.rpm: CabeceraV3 RSA/SHA256 Signature, ID de clave 41a40948: NOKEY
Preparando...               ########################################### [100%]
   1:puias-computational    ########################################### [100%]

# yum install MixKit

Otra vez con la instalación de vis5d+-1.2.1

$ ./configure --with-mixkit=/usr/lib64/
$ make

Finalmente no se pudo instalar ARWPost en la máquina Scientific Linux donde tenemos WRF por problemas, pienso yo, de algunas librerías.

Se procede a instalar entonces en una máquina virtual con la distribución GNU/Linux Ubuntu. La intalación se realiza de la siguiente manera (http://youtu.be/zXvfQ4i0IJE):

Descargar ARWPost desde la página http://www.mmm.ucar.edu/wrf/users/download/get_sources.html

Nota: Para la descarga hay que suscribirse de manera gratuita al sitio.

El link de descarga de la versión 3.1 es la siguiente: http://www.mmm.ucar.edu/wrf/src/ARWpost_V3.tar.gz

Una vez descargado el paquete de ARWPost se realizan los siguientes pasos:

Nota: Se debe tener compilado NetCDF en la máquina en la que se piensa instalar ARWPost.

$ tar -xvzf ARWpost_V3.tar.gz
$ cd ARWpost
$ ./configure

** WARNING: No path to NETCDF and environment variable NETCDF not set.
** would you like me to try to fix? [y]
y
Enter full path to NetCDF include directory on your system
/usr/local/include
Enter full path to NetCDF library directory on your system
/usr/local/lib
created new ./netcdf_links directory
total 0
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 18 abr 18 15:41 include -> /usr/local/include/
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 14 abr 18 15:41 lib -> /usr/local/lib/
Will use NETCDF in dir: /home/angelv/ARWpost/netcdf_links
------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.

   1.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, PGI compiler   
   2.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, Intel compiler   
   3.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, gfortran compiler

Enter selection [1-3] : 2  
------------------------------------------------------------------------
Configuration successful. To build the ARWpost, type: compile
------------------------------------------------------------------------

$ ./compile

******************************************************************************************
GrADS
******************************************************************************************

Instalación de GrADS (He seguido los pasos que se muestran en "Como instalar GrADS"  http://youtu.be/e4s92fer85s)


Descargar de la página oficial el código fuente (source) para compilarlo. http://www.iges.org/grads/downloads.html

Nota: Los pasos a seguir están mostrados en el archivo INSTALL en el archivo comprimido en source.tar.gz.
Nota: Tutorial en español con un ejemplo de uso de GrADS está en: http://www.iges.org/grads/gadoc/

$ tar -xvzf grads-2.0.1-src.tar.gz
$ cd grads-2.0.1
$ ./configure

.
.
.

- OPeNDAP for station data disabled

  +=========================================================================+
   GrADS 2.0.1 : Built Wed May 2 17:53:35 ECT 2012 for x86_64-unknown-linux-gnu
  +=========================================================================+

  +-------------------------------+
  |                               |
  |  GrADS will be built with:    |
  |                               |
  |  - GUI disabled               |
  |  - readline disabled          |
  |  - geotiff disabled           |
  |  - shapefile disabled         |
  |  - printim disabled           |
  |  - grib2 disabled             |
  |  - hdf4 disabled              |
  |  - hdf5 disabled              |
  |  - netcdf disabled            |
  |  - OPeNDAP disabled           |
  |                               |
  |  gxtran will not be built     |
  |  grib2scan will not be built  |
  |                               |
  +-------------------------------+
configure: creating src/VERSION
configure: creating src/buildinfo.h
configure: creating ./config.status
config.status: creating Makefile
config.status: creating src/Makefile
config.status: creating src/config.h

Run 'make && make install' to build GrADS.
Executables will be installed to bin/ in current dir, unless prefix was specified.

# make && make install

Cuando se manda make && make install sale el siguiente error:

.
.
.
gxdxwd.c:16:29: error: X11/Xmu/WinUtil.h: No existe el fichero o el directorio
make[2]: *** [gxdxwd.o] Error 1
make[2]: se sale del directorio `/home/angelv/Descargas/grads-2.0.1/src'
make[1]: *** [all] Error 2
make[1]: se sale del directorio `/home/angelv/Descargas/grads-2.0.1/src'
make: *** [all-recursive] Error 1

En la siguiente página se da la solución a este problema: http://dougsland.livejournal.com/54995.html

Se debe instalar libxmu-dev

Ahora mandamos a instalar make && make install ([root@localhost grads-2.0.1]# make && make install)

$ make
$ make check
# make install

Una vez que está compilado GrADS, pasamos todos los ejecutables (los que se generan luego de la compilación) que están en el directorio bin hacia el directorio /usr/local/bin.

Cuando ya se va a abrir una salida de WRF y si no están instalados datos 2, sale esto:

.
.
.
Error opening stroke character data set
  Data set names = /usr/local/lib/grads/font0.dat ; font0.dat
Error opening stroke character data set
  Data set names = /usr/local/lib/grads/font0.dat ; font0.dat

Instalación de datos (datos2.tar.gz)
------------------------------------

Se debe instalar el archivo datos2.tar.gz desde la página web http://grads.iges.org/grads/downloads.html

Nota: Los pasos a seguir están mostrados en el archivo INSTALL en el archivo comprimido en source.tar.gz.

Todos los archivos que están empoquetados se copian a un directorio del sistema llamado /usr/local/lib/grads (el directorio grads dentro de lib se debe crear).

Una vez instalados GrADS y sus respectivos datos (datos2.tar.gz), se puede hacer una prueba con la salida de ARWPost.

Copiamos los archivos de salida de ARWPost (salida.ctl y salida.dat) al directorio de GrADS y en la terminal del sistema ponemos

$ grads
ga> open salida.ctl
ga> d t2
ga> d t
ga> d u10m

Seguir lo que dice en el siguiente manual
-----------------------------------------

    http://www.cmc.org.ve/mediawiki/index.php?title=%E2%97%A6_WRF


Para descargarse las librerías, hay una lista de esos datos a bajar
-------------------------------------------------------------------

    http://www.mmm.ucar.edu/wrf/users/download/get_sources.html


Sistema operativo: GNU/Linux
Distribución: Scientific Linux
Versión: 6.1
------------------------------
------------------------------


1. Descargar software necesario
-------------------------------

Descarga de WRF y WPS desde la página oficial. Se ha instalado la versión 3.3.1

http://www.mmm.ucar.edu/wrf/src/

Datos de topografía

www.mmm.ucar.edu/wrf/src/wps_files/geog.tar.gz

Librerías adicionales necesarias

www.mmm.ucar.edu/wrf/src/wps_files/jasper-1.701.0.tar.gz
www.mmm.ucar.edu/wrf/src/wps_files/libpng-1.2.12.tar.gz
www.mmm.ucar.edu/wrf/src/wps_files/zlib-1.2.3.tar.gz

NetCDF (la librería más importante para WRF). La última versión (ahora es la versión 4.1.3).

http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/index.jsp

WRFDomainWizard

http://wrfportal.org/domainwizard/WRFDomainWizard.zip

2. Instalación de compiladores y paquetes adicionales
-----------------------------------------------------

    NOTA IMPORTANTE: Para todos los paquetes que se instalen y compilen en adelante, se debe utilizar las MISMAS VERSIONES de los compiladores.
    ---------------

# yum install gcc
# yum install gcc-gfortran
# yum install gcc-c++ (necesario para compilar NetCDF)
# yum install make
# yum install perl (en Scientific Linux ya está instalado por defecto)
# yum install java (necesario para correr WRFDomianWizard)

3. Instalación de librerías adicionales
---------------------------------------

Se recomienda instalar un editor llamado nano, para poder hacer cualquier creación o modificación de scripts en lo posterior mediante consola (terminal): # yum install nano.

ZLIB (Instalar con -fPIC: export CFLAGS=-fPIC antes de todo)

$ zlib-1.2.3.tar.gz
$ cd zlib-1.2.3
$ ./configure
$ make
$ make check
# make install


JASPER

$ tar -xvzf jasper-1.701.0.tar.gz
$ cd jasper-1.701.0
$ ./configure
$ make
$ make check
# make install

LIBPNG

$ tar -xvzf libpng-1.2.12.tar.gz
$ cd libpng-1.2.12
$ ./configure
$ make

    ERROR:    /usr/bin/ld: /usr/local/lib/libz.a(crc32.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC
        /usr/local/lib/libz.a: could not read symbols: Bad value
        collect2: ld returned 1 exit status

    Posible solución: http://www.gentoo.org/proj/en/base/amd64/howtos/index.xml?part=1&chap=3

    Si al momento de contruir (make) sale un error que pide que se recompile con -fPIC, se debe inicializar la variable CFLAGS = "-O3 -fPIC". Y luego de eso volver a ./configure. Así:
        $ export CFLAGS="-O3 -fPIC"
        $ ./configure

    Se puede ver el contenido de una variable de la sigui./run_DomainWizard
ente manera:
   
        $ echo $NOMBRE_VARIABLE

    Se puede borrar el valor de una variable de la siguiente manera:

        $ unset NOMBRE_VARIABLE

        NO PUDE ARREGLAR EL ERROR. Se puede instalar con: # yum install libpng. En Scientific Linux 6.1 ya está instalada la versión 1.2.46-2
        --------------------------
   
$ make check
# make install

4. Instalación NetCDF
---------------------

Se lo ha puesto como un subtítulo puesto que es la librería más importante para WRF.

$ tar -xvzf netcdf-4.1.3.tar.gz
$ cd netcdf-4.1.3
$ ./configure --disable-netcdf-4
$ make
$ make check
# make install

Para comprobar la instalación (se lo debe hacer pues es muy importante para WRF) se puede usar el siguiente comando:

ls /usr/local/include/netcdf*

El resultado debe contener los siguientes archivos:

/usr/local/include/netcdfcpp.h
/usr/local/include/netcdf.h
/usr/local/include/netcdf.hh
/usr/local/include/netcdf.inc
/usr/local/include/netcdf.mod

El siguiente comando:

ls /usr/local/lib/libnetcdf*

El resultado debe contener los siguientes archivos:

/usr/local/lib/libnetcdf.a    
/usr/local/lib/libnetcdf_c++.la
/usr/local/lib/libnetcdf_c++.a
/usr/local/lib/libnetcdf.la

5. Instalación de WRF
---------------------

$ tar -xvzf WRFV3.3.1.TAR.gz
$ cd WRFV3

Necesitaremos ahora agregar unas nuevas líneas al /etc/bashrc. Son las que se ven a continuación:

$ export JASPERLIB=/opt/jasper-1.701.0
$ export JASPERINC=/opt/jasper-1.701.0
$ ulimit -s unlimited

Para actualizar las variables de ambiente, como es usual:

$ source /etc/bashrc

$ ./configure

Aparece lo siguiente:

checking for perl5... no
checking for perl... found /usr/bin/perl (perl)
** WARNING: No path to NETCDF and environment variable NETCDF not set.
** would you like me to try to fix? [y]

decimos "y" e incluimos los PATH:

/usr/local/include
/usr/local/lib

en cada uno de los casos que pregunta. Si hemos hecho todo bien aparecerá un menú (al principio de todo indica que se han reconocido los caminos a la biblioteca JASPER):

Please select from among the following supported platforms.

   1.  Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (serial)
   2.  Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (smpar)
   3.  Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (dmpar)
   4.  Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (dm+sm)
   5.  Linux x86_64, PGI accelerator compiler with gcc  (serial)
   6.  Linux x86_64, PGI accelerator compiler with gcc  (smpar)
   7.  Linux x86_64, PGI accelerator compiler with gcc  (dmpar)
   8.  Linux x86_64, PGI accelerator compiler with gcc  (dm+sm)
   9.  Linux x86_64 i486 i586 i686, ifort compiler with icc  (serial)
  10.  Linux x86_64 i486 i586 i686, ifort compiler with icc  (smpar)
  11.  Linux x86_64 i486 i586 i686, ifort compiler with icc  (dmpar)
  12.  Linux x86_64 i486 i586 i686, ifort compiler with icc  (dm+sm)
  13.  Linux i486 i586 i686 x86_64, PathScale compiler with pathcc  (serial)
  14.  Linux i486 i586 i686 x86_64, PathScale compiler with pathcc  (dmpar)
  15.  x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc   (serial)
  16.  x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc   (smpar)
  17.  x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc   (dmpar)
  18.  x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc   (dm+sm)
  19.  Cray XT CLE/Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (seri./run_DomainWizard
al)
  20.  Cray XT CLE/Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (smpar)
  21.  Cray XT CLE/Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (dmpar)
  22.  Cray XT CLE/Linux x86_64, PGI compiler with gcc  (dm+sm)
  23.  Cray XT CLE/Linux x86_64, Cray CCE compiler with gcc  (serial)
  24.  Cray XT CLE/Linux x86_64, Cray CCE compiler with gcc  (smpar)
  25.  Cray XT CLE/Linux x86_64, Cray CCE compiler with gcc  (dmpar)
  26.  Cray XT CLE/Linux x86_64, Cray CCE compiler with gcc  (dm+sm)

Enter selection [1-26] : 15

Compile for nesting? (0=no nesting, 1=basic, 2=preset moves, 3=vortex following) [default 0]: 1

Configuration successful. To build the model type compile .

Testing for NetCDF, C and Fortran compiler

no entry nc.o in archive
This installation NetCDF is
C compiler is 64-bit
Fortran compiler is 64-bit
It will build in

¡YA!
----

$ ./compile em_real

Y SE COMIENZA A COMPILAR
------------------------

Para comprobar que se haya realizado con éxito la compilación. Se deben encontrar en el directorio main (dentro de WRFV3), entre otros, los siguientes archivos:

$ ls run/*.exe

wrf.exe
real.exe
nup.exe
ndown.exe
tc.exe
ndown.exe

Para hacer una prueba se puede bajar el siguiente archivo empaquetado: http://www.mmm.ucar.edu/wrf/src/data/jan00_wps.tar.gz

Se lo pone dentro de test/em_real

$ cd test/em_real
$ tar -xvzf jan00_wps.tar.gz
$ cp namelist.input.jan00 namelist.input
$ ./real.exe

    Puede salir el siguiente error: ./real.exe: error while loading shared libraries: libnetcdff.so.5: cannot open shared object file: No such file or directory
    Solución: $ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib


Para recompilar

$ ./clean -a
$ ./configure
$ ./compile

INSTALACIÓN WPS
---------------

$ tar -xvzf WPSV3.3.1.TAR.gz
$ cd WPS/
$ export JASPERLIB=/opt/jasper-1.701.0
$ export JASPERINC=/opt/jasper-1.701.0

    NOTA: Aquí se muestra cómo hacer para que se configure WPS con grib2: https://nesccdocs.rdhpcs.noaa.gov/wiki/index.php/WPS
    Básicamente se tiene que poner en configure.wps
        COMPRESSION_LIBS = -ljasper -lpng12 -lpng -lz

$ ./configure
** WARNING: No path to NETCDF and environment variable NETCDF not set.
** would you like me to try to fix? [y]
y
Enter full path to NetCDF include directory on your system
/usr/local/include
Enter full path to NetCDF library directory on your system
/usr/local/lib
created new ./netcdf_links directory
total 0
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 18 mar  5 16:31 include -> /usr/local/include/
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 14 mar  5 16:31 lib -> /usr/local/lib/
Will use NETCDF in dir: /home/angelv/WPS/netcdf_links
$JASPERLIB or $JASPERINC not found in environment, configuring to build with grib2 I/O...
------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.

   1.  PC Linux x86_64, Intel compiler    serial, NO GRIB2
   2.  PC Linux x86_64, Intel compiler    serial
   3.  PC Linux x86_64, Intel compiler    DM parallel, NO GRIB2
   4.  PC Linux x86_64, Intel compiler    DM parallel
   5.  PC Linux x86_64, gfortran compiler,    serial, NO GRIB2
   6.  PC Linux x86_64, gfortran compiler,    serial
   7.  PC Linux x86_64, gfortran compiler,    DM PARALLEL, NO GRIB2
   8.  PC Linux x86_64, gfortran compiler,    DM PARALLEL
   9.  PC Linux x86_64 (IA64 and Opteron), PGI compiler 5.2 or higher, serial, NO GRIB2
  10.  PC Linux x86_64 (IA64 and Opteron), PGI compiler 5.2 or higher, serial
  11.  Cray XT/XE Linux x86_64 (Opteron), PGI compiler 5.2 or higher, DM parallel
  12.  Cray XT/XE Linux x86_64 (Opteron), PGI compiler 5.2 or higher, DM parallel, NO GRIB2
  13.  Cray XT/XE Linux x86_64 (Opteron), Cray CCE compiler 7.0 or higher, DM parallel
  14.  Cray XT/XE Linux x86_64 (Opteron), Cray CCE compiler 7.0 or higher, DM parallel, NO GRIB2
  15.  PC Linux x86_64 (IA64 and Opteron), PGI compiler 5.2 or higher, DM parallel, NO GRIB2
  16.  PC Linux x86_64 (IA64 and Opteron), PGI compiler 5.2 or higher, DM parallel
  17.  PC Linux x86_64 (IA64 and Opteron), PathScale compiler 2.1 or higher, serial, NO GRIB2
  18.  PC Linux x86_64 (IA64 and Opteron), PathScale compiler 2.1 or higher, DM parallel, NO GRIB2
  19.  PC Linux x86_64, g95 compiler,    serial, NO GRIB2
  20.  PC Linux x86_64, g95 compiler,    serial
  21.  PC Linux x86_64, g95 compiler,    DM PARALLEL, NO GRIB2
  22.  PC Linux x86_64, g95 compiler,    DM PARALLEL

Enter selection [1-22] : 8
------------------------------------------------------------------------
Configuration successful. To build the WPS, type: compile
------------------------------------------------------------------------

$ ./compile

**********************************************************************************************************************
**************************************  WRFDomainWizard  *************************************************************
**********************************************************************************************************************

WRFDomainWizard
---------------
---------------

Descompresión del programa. Se lo ha realizado dentro de la carpeta personal /home/angelv/WRFDomainWizard

$ unzip WRFDomainWizard.zip (este comando descomprime los archivos donde esté WRFDomainWizard.zip)

Cambiamos los permisos de ejecución del lanzador del programa (http://belinuxmyfriend.blogspot.com/2007/04/chmod-jugando-con-los-permisos.html):

$ chmod 777 run_DomainWizard

$ ./run_DomainWizard

Datos no transitorios
---------------------

Descargar datos geográficos (454 MB) de: http://www.mmm.ucar.edu/wrf/src/wps_files/geog.tar.gz

Descomprimir los datos geográficos (13 GB). Se lo puede hacer en cualquier directorio; en este caso se lo ha descomprimido en el directorio donde está WPS (/home/angelv/WPS).

$ tar -xvzf geog.tar.gz

Uso de WRFDomainWizard
----------------------

NOTA: Por facilidad (para no usar línea de comandos) se ha creado un lanzador o acceso directo a WRFDomainWizard para acceder desde el escritorio.
    Click derecho en el Escritorio
    Crear Lanzador
    Se ingresan los siguientes datos
        Tipo: Aplicación
        Nombre: WRFDomainWizard (Este nombre puede ser cualquiera)
        Comando: java -Xmx575m -jar /home/angelv/WRFDomainWizard/WRFDomainWizard.jar
        Comentario: GUI para uso de WPS (Puede ser cualquier comentario)

Primero se configuran los parámetros de WRFDomainWizard

    NOTA: Se crea un directorio para los resultados de ejecución de WPS (para usarlo en el parámetro Domains al momento de configurar WRFDomainWizard): $ mkdir /home/angelv/WPS/Domains

Computer (se rellena automáticamente luego de ingresar los siguientes tres parámetros): localhost.localdomain
WPS Programs: /home/angelv/WPS
Geography: /home/angelv/WPS/geog
Domains: /home/angelv/WPS/Domains

NOTA: Para ver el uso de WRFDomainWizard: http://wrfportal.org/DomainWizard.html


Para instalar Skype en Scientific Linux: http://unix.stackexchange.com/questions/25846/skype-missing-gpg-key


PRUEBA DE EJECUCIÓN CON WRF
---------------------------

$ ./real.exe

    Salió este error:
-------------- FATAL CALLED ---------------
 FATAL CALLED FROM FILE:    LINE:     693
  input_wrf.F: SIZE MISMATCH:  namelist ide,jde,num_metgrid_levels=         100         132          65 ; input data ide,jde,num_metgrid_levels=         100         132          27

Aquí tuve pistas para resolver el problema: http://forum.wrfforum.com/viewtopic.php?f=9&t=2781

El error dice que no hay consistencia entre el valor configurado en la variable num_metgrid_levels y los valores que existen para hacer la corrida. Hay que editar el valor de la variable, cambiando de 65 a 27 (como se indica en el archivo mismo).

Luego de una ejecución exitosa debe aparecer el siguiente resultado:

 Domain  1: Current date being processed: 2012-03-30_00:00:00.0000, which is loop #   9 out of    9
 configflags%julyr, %julday, %gmt:        2012          90   0.0000000   
  metgrid input_wrf.F first_date_input = 2012-03-30_00:00:00
  metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2012-03-29_00:00:00
 d01 2012-03-30_00:00:00 Timing for input          0 s.
 d01 2012-03-30_00:00:00          flag_soil_layers read from met_em file is  1
 Using sfcprs3 to compute psfc
 d01 2012-03-30_00:00:00 Old data, no inland lake information
  Assume Noah LSM input
 LAND  CHANGE =            0
 WATER CHANGE =            0
 d01 2012-03-30_00:00:00 Timing for processing          0 s.
 LBC valid between these times 2012-03-29_21:00:00.0000 2012-03-30_00:00:00    
 d01 2012-03-30_00:00:00 Timing for output          0 s.
 d01 2012-03-30_00:00:00 Timing for loop #    9 =          1 s.
 d01 2012-03-30_00:00:00 real_em: SUCCESS COMPLETE REAL_EM INIT

$ ./wrf.exe

Timing for Writing wrfout_d01_2012-03-29_03:00:00 for domain        1:    0.30800 elapsed seconds.
 d01 2012-03-29_03:00:00 wrf: SUCCESS COMPLETE WRF

ERROR ERROR ERROR
-----------------
-----------------

Por aquí puede estar la solución: http://forum.wrfforum.com/viewtopic.php?f=6&t=2531


[angelv@localhost em_real]$ ./wrf.exe
 Namelist dfi_control not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in dfi_control
 Namelist tc not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in tc
 Namelist scm not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in scm
 Namelist fire not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in fire
 --- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
 --- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
 --- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
 --- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
 --- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
 WRF V3.3.1 MODEL
  *************************************
  Parent domain
  ids,ide,jds,jde            1         100           1         132
  ims,ime,jms,jme           -4         105          -4         137
  ips,ipe,jps,jpe            1         100           1         132
  *************************************
 DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
    alloc_space_field: domain            1 ,             596733464  bytes allocated
   med_initialdata_input: calling input_input
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        1:    0.17400 elapsed seconds.
 INPUT LandUse = "USGS"
 LANDUSE TYPE = "USGS" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           16  SNOW CATEGORY =           24
 INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
  LANDUSE TYPE = USGS FOUND          27  CATEGORIES
  INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
  SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
Timing for Writing wrfout_d01_2012-03-29_00:00:00 for domain        1:    0.86100 elapsed seconds.
Timing for processing lateral boundary for domain        1:    0.04900 elapsed seconds.
 WRF TILE   1 IS      1 IE    100 JS      1 JE    132
 WRF NUMBER OF TILES =   1
Timing for main: time 2012-03-29_00:03:00 on domain   1:   25.85200 elapsed seconds.
Timing for main: time 2012-03-29_00:06:00 on domain   1:   15.83300 elapsed seconds.
Timing for main: time 2012-03-29_00:09:00 on domain   1:   15.50600 elapsed seconds.
Timing for main: time 2012-03-29_00:12:00 on domain   1:   16.01300 elapsed seconds.
Timing for main: time 2012-03-29_00:15:00 on domain   1:   15.59900 elapsed seconds.
Timing for main: time 2012-03-29_00:18:00 on domain   1:   16.03300 elapsed seconds.
 Flerchinger USEd in NEW version. Iterations=          10
 Flerchinger USEd in NEW version. Iterations=          10
 Flerchinger USEd in NEW version. Iterations=          10
  WOULD GO OFF TOP: KF_ETA_PARA I,J,DPTHMX,DPMIN          52          89             NaN   5000.0000
Violación de segmento

--------------------
--------------------
ERROR ERROR ERROR

-----------------------------------------------------------------------------------------
-----------------------------------------------------------------------------------------
***************************** INSTALACIÓN DE ARW POST *******************************************************************************
-----------------------------------------------------------------------------------------
-----------------------------------------------------------------------------------------

VIDEO QUE DA CÓMO COMPILAR http://youtu.be/zXvfQ4i0IJE

ARWpost:
ARWpost, is a Fortran program that reads WRF ARW input and output file and generate GrADS output files.

Once the output files have been generated, GrADS can be used to producing horizontal or vertical cross section plots of scalar fields (contours) or vector fields (barbs or arrows), vertical profiles and soundings.

$ tar -xvzf ARWpost_V3.tar.gz
$ cd ARWpost
$ ./configure

** WARNING: No path to NETCDF and environment variable NETCDF not set.
** would you like me to try to fix? [y]
y
Enter full path to NetCDF include directory on your system
/usr/local/include
Enter full path to NetCDF library directory on your system
/usr/local/lib
created new ./netcdf_links directory
total 0
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 18 abr 18 15:41 include -> /usr/local/include/
lrwxrwxrwx. 1 angelv angelv 14 abr 18 15:41 lib -> /usr/local/lib/
Will use NETCDF in dir: /home/angelv/ARWpost/netcdf_links
------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.

   1.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, PGI compiler   
   2.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, Intel compiler   
   3.  PC Linux i486 i586 i686 x86_64, gfortran compiler

Enter selection [1-3] : 2  
------------------------------------------------------------------------
Configuration successful. To build the ARWpost, type: compile
------------------------------------------------------------------------

$ ./compile

Se dió el siguiente error:

    module_interp.f:(.text+0x6ece): undefined reference to `ncvgt_'
    collect2: ld devolvió el estado de salida 1
    make: [ARWpost.exe] Error 1 (no tiene efecto)

Instalación de Vis5D

Descargar desde la página web oficial: http://www.ssec.wisc.edu/~billh/vis5d.html

$ tar -xvzf vis5d+-1.3.0-beta.tar.gz
$ cd vis5d+-1.3.0-beta
$ ./configure

****************************************************
You need to install a 3D graphics library, preferably
the free OpenGL replacement, Mesa.  You can download
Mesa from the Mesa home page:
          http://www.mesa3d.org/
and install it by running:
       ./configure && make && su -c 'make install'
in the Mesa directory.
You may also need to run /sbin/ldconfig as root
to update the system after installing Mesa.
(First, add '/usr/local/lib' to /etc/ld.so.conf if
you installed Mesa under /usr/local, the default.)
****************************************************

Referencias:
[1] http://ingfomentor.blogspot.com/2011/11/hola-mundo-con-wicket-en-eclipse-sobre.html
[2] http://youtu.be/3fdiCBb4rK8

1. Descargar el IDE desde la página oficial de NetBeans [1].
2. Con el paquete en algún directorio local, desde el terminal tecleamos [2]: sudo sh netbeans-7.0.1-ml-linux.sh
3. Se nos lanza el instalador.

1. Desinstalé todos los paquetes de la versión actual (En Synaptic se marca todos los paquetes para su desinstalación).
2. Descargué el paquete (.DEB) de la página oficial de OpenOffice.
3. Copié el archivo a la carpeta personal (es opcional, sólo por comodidad).
4. tar -vxzf nombreDeArchivo.tar.gz
5. cd directorio_OOo/DEBS (directorio_OOo es el desempaquetado de nombreDeArchivo.tar.gz)
6. sudo dpkg -i *.deb
7. cd desktop-integration (esta carpeta está dentro de directorio_OOo/DEBS)
8. sudo dpkg -i *.deb

Fuente

Pantalla Principal de Ext2Read

Pequeña parte de mi tesis que fue borrada, a alguien le servirá.

• Roos, Dave. “Top 5 Myths About Google, Inc..” HowStuffWorks, n.d. http://electronics.howstuffworks.com/tech-myths/5-myths-about-google.htm.